三、蛋白质的分子结构1. 蛋白质一级结构：概念：指多肽链中氨基酸的排列顺序。主要化学键：肽键。2. 蛋白质的二级结构：概念：蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。主要化学键：氢键 肽单元：参与肽键的6个原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位于同一平面，Ca1和Ca2在平面上所处的位置为反式(trans)构型，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 (peptide unit) 。四种主要结构形式（α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷曲）。模体：在许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，被称为模体(motif)。常见的有：钙结合蛋白中结合钙离子的模体、锌指结构。 氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响：一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成a-螺旋或β-折叠，它就会出现相应的二级结构。 3. 蛋白质的三级结构：概念：整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。主要次级键——疏水作用、离子键（盐键）、氢键、范德华力等，结构域（domain）：大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各行使其功能，称为结构域(domain) 。分子伴侣(chaperon)：通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。4. 蛋白质的四级结构：概念：蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。亚基：有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基 (subunit)。各亚基之间的结合力：疏水作用、氢键、离子键。
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