1、舰岛
岛式上层建筑是现代航母的标志性船体结构之一。其实早期的航母并没有岛式建筑，许多航母是由其他舰船改装的，在原有主甲板上用钢柱支撑起一个飞机起降平台。上面起降飞机，下面就是简易机库。经过许几十年的运用实践，才逐步演进成了现在我们所见到的岛式建筑。
岛型建筑不仅可以使操舰人员和指挥人员可以站得更高，看得更远，而且可以将烟囱收在其中，废气向上方排出，减少了排烟对飞行员的影响。早期航母的烟囱设置在舷侧，并且比较低矮，航行时浓烟经常弥漫甲板，不仅影响飞行员的视线，也对飞机产生腐蚀。
2、飞行甲板
航母的一大特征即是巨大的平直甲板，供飞机起降之用，有“海上机场”之称。不同于陆基飞机在起飞速度不足时仅需延长起飞时间，航母甲板上的空间十分有限，因此甲板设计对航母的战斗能力有很重要的影响。
现今只有轻型航母仍采用全通式甲板，并结合滑跳式甲板的设计，舰载机为直升机与短距起降飞机的话仍可满足起降效率。此外，通常其舰身左侧为起飞区，右侧舰岛前后处为停机区。
中型乃至大型航母皆采用斜角式甲板，舰前方的直通式部份用于飞机起飞，长约70至100米。其斜角式部份则位于主甲板左侧，用于飞机降落，约长220至270米，两部分夹角6至13度。
3、机库
机库为储存和整备航空母舰舰载机的地方，又分成“开放”和“封闭”两种。采用开放结构的航母舰体为机库，甲板上方再额外建造机库墙壁、甲板支撑柱等结构，再加上飞行甲板。
开放机库的优点为通风良好、伤害管制佳，炸弹若击入机库中爆炸造成的冲击波会释放到外面；结构较轻、容纳飞机多以及可依舰载机尺寸作修正。
4、升降机
升降机是将舰载机自机库运输至飞行甲板的装置，早期配置于全通飞行甲板的舰身中线的前中或后方，通常为2至3具。升降机也是甲板上最脆弱的部份，如果升降机故障或是遭到破坏会导致飞机无法起降，进而丧失战斗力。
现代大型航母的升降机宽20多米、深达15米、可负重100吨，升降速度约为一分钟自机库搬上一架飞机至甲板。
5、武器库
武器库是用来储备各种炸弹、鱼雷、导弹与火箭的区域，位于船舰底部、水线之下，为船头尾各一处，中间则为机库，这些武器多以半组装方式收纳。
冷战时期基于核子武器的机密和敏感性，这些弹药库的使用、人员进出管制与保安都有特别的处理和操作程序，没有受到相关训练验证或者是无关的人员一概不得靠近。
第一款安装SASS的航母是透过《27A改装案》来加装相关设备与空间的埃塞克斯级，在设计阶段就将SASS融入舰身结构的则是“福莱斯特级”航母。
