1 合肥同步辐射国家实验室 依托单位：中国科技大学
2 北京正负电子对撞机国家实验室 依托单位：中科院高能物理所
3 兰州重离子加速器国家实验室 依托单位：中科院兰州近代物理所
4 沈阳材料科学国家（联合）实验室 依托单位：中科院沈阳金属所
5微尺度实验室 依托单位：中国科技大学
6 信息科学实验室 依托单位：清华大学
7分子化学实验室 依托单位：北京大学、中科院化学所
8武汉光电实验室 依托单位：华中科大、武汉邮科院、武汉数理所、中船717所
9 凝聚态实验室 依托单位：中科院物理所
10海洋方面－－－－青岛海洋科学与技术国家实验室
依托中国海洋大学、青岛海洋研究所
11航空航天方面－－－－航空科学与技术国家实验室
依托北京航空航天大学
12人口与健康方面－－－－重大疾病研究国家实验室
依托中国医学科学院
13核能方面－－－－磁约束核聚变国家实验室
依托中国科学院合肥物质科学研究院、西南核物理研究院
14新能源方面－－－－洁净能源国家实验室
依托中国科学院大连化学物理研究所
15先进制造方面－－－－船舶与海洋工程国家实验室
依托上海交通大学
16量子调控方面－－－－微结构国家实验室
依托南京大学
17蛋白质研究方面－－－－蛋白质科学国家实验室
依托中国科学院生物物理研究所
18轨道交通方面--------现代轨道交通国家实验室
依托西南交通大学
19农业方面----------现代农业国家实验室
依托中国农业大学
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